Úspěšnější tým v normální hrací době získá jako dosud tři body, poražený žádný. Vítěz prodloužení nebo samostatných nájezdů bude oceněn dvěma body, neúspěšný tým jedním. V nájezdech se pojede série po třech a až pak po jednom.
Odsouhlasena byla také kvóta čtyř cizinců.
Již dříve známou změnou je rozšíření soutěže od ročníku 2007/08 na šestnáct týmů. Dva vítěze play-off druholigových skupin Střed a Západ i nejlepší tým skupiny Východ tak čeká kvalifikace o dvě postupová místa do první ligy.
V případě, že šampion druhé nejvyšší soutěže složí kauci 25 milionů korun a posune se do extraligy, z druhé ligy postoupí výš všichni tři vítězové.
Druhá hokejová liga u remíz po pětiminutovém prodloužení zůstává, ale ke změně došlo v herním systému. Ve všech třech dvanáctičlenných se bude hrát každý s každým čtyřikrát, takže se místo dosavadních 34 kol uskuteční o deset více.
Nový ročník odstartuje rovněž 13. září. V play-off se hraje na tři vítězné zápasy, přičemž lépe postavený tým bude hrát nově doma první dva zápasy a potom případný pátý rozhodující.
Složení první hokejové ligy pro ročník 2006/07:
Ústí nad Labem, Mladá Boleslav, Jihlava, Chomutov, Beroun, Kometa Brno, Sareza Ostrava, Kadaň, Hradec Králové, Havířov, Olomouc, Třebíč, Prostějov, Havlíčkův Brod.
Složení skupin druhé ligy pro ročník 2006/07:
Západ: Jablonec nad Nisou, Klatovy, Řisuty, Sokolov, Klášterec nad Ohří, Most, Děčín, Kobra Praha, Hvězda Praha, Slaný, Teplice, Mělník.
Střed: Jindřichův Hradec, Vrchlabí, Písek, Benátky nad Jizerou, Chrudim, Tábor, Nymburk, Milevsko, Pelhřimov, Strakonice, Kolín, Žďár nad Sázavou.
Východ: Technika Brno, Šternberk, Blansko, Orlová, Nový Jičín, Valašské Meziříčí, Šumperk, Velká Bíteš, Hodonín, Přerov, Kroměříž, Velké Meziříčí.